在動物考古學界，研究地中海的魚骨就像走入了死胡同。自從歷史學家 Thomas Gallant 於 1980 年代著書，表明貧瘠的古希臘海洋無法支撐重要漁業，便一直主導了學術界對古代地中海的看法，推測因很少河流流入地中海，以致浮游生物稀少，令海洋食物鏈欠缺基礎。然而，希臘的動物考古學家 Dimitra Mylona 質疑有關證據不足，於 90 年代攻讀研究生時已立志專研魚骨，希望重新發掘古代地中海文明實況。
用現代目光看待過去
Mylona 生於希臘北部一個以魚類為主食的地區。1991 年，她在克里特島具有 3,500 年歷史的米諾斯（Minoan）文明遺址帕萊卡斯特羅（Palaikastro）挖掘出許多細小魚骨。適逢當時希臘考古學家剛開始採用更精細的浮選法（water flotation method）研究土壤，發現愈來愈多魚類遺骸。惟學術界普遍認為山羊和綿羊才是古希臘人首選的肉類蛋白質來源，當時發掘的魚骨數量，尚未足以改變學者們對古希臘漁業的想像。
1993 年 Mylona 著手籌備魚骨檔案庫，用來比較魚骨遺骸與現代魚類。因希臘的大學不教授動物考古學，之前並沒有任何存檔。10 年間，她經常前往克里特島的魚市場或停泊漁船購買各種魚類，埋於泥土數月待其腐化，再將掘出的魚骨像整理圖書一樣歸檔，藉此對照及計算古代魚骨遺骸，希望為古代漁業建立基準資料。但收集現代漁業的基準數據也絕非易事，因圍繞地中海的 22 個國家，濫捕情況愈演愈烈。
聯合國糧食及農業組織估計，2019 年地中海和黑海只有 36.7% 的魚類被可持續捕撈。埃及在 1970 年代建造阿斯旺大壩後，經尼羅河三角洲流入地中海的養分減少，令浮游生物數量下降，該地區其他水壩亦造成類似破壞。1869 年，連接地中海和紅海的蘇彝士運河落成，藉此避開繞過非洲之角的昂貴航運，自此數百種外來物種湧入地中海，為現今全球入侵最嚴重的海域，部分入侵物種如圓斑兔頭魨更具毒性。
當年 Gallent 的論述，或許正是歷史生態學家所謂的當下主義（presentism）—— 以現代目光看待過去 —— 的例子。而收集魚骨比哺乳動物遺骸更難，因為魚骨通常很小，即使如 7 公斤的石斑魚，留下的骸骨可能亦不超過兩厘米。Mylona 首次對 4 根大魚骨進行浮選法時，從中又發現了 4,000 根魚骨；考古學家以相同方法研究愛琴海及許多沿海遺址時，幾乎在每處都發現成百上千的魚骨，魚類顯然是古希臘飲食的重要來源。
缺乏過往的紀錄，對現在有甚麼影響？
對古代地中海漁業的誤解，加上一直缺乏基準數據，更影響了現代漁業的發展。漁業研究員 Manos Koutrakis 一直收集家鄉卡瓦拉（Kavala）的漁業數據，發現其魚量在過去 50 年大幅下降。2015 年，希臘統計局考慮禁止 20 匹馬力以下的船隻捕魚，但希臘大多數漁船可能都屬此類。另外，大型捕魚船的出現亦影響當地漁民生計，惟至 2016 年希臘才創建網上數據庫，收集長度超過 12 米的船隻出海數量。
儘管世界各地漁業也陸續轉向配額管理，如採取季節性開放及限制捕魚網尺寸等措施，但希臘漁業因缺乏精確數據，難以制訂有效方案；2017 年起，歐盟終於訂立法規以確保數據質量。另外，不列顛哥倫比亞大學海洋生物學家 Daniel Pauly 在 1995 年提出了「轉移基準」的假設，認為每一代人衡量漁穫的基線會向下移，例如以往的希臘漁夫可能在 1 小時內捕獲 100 條鯛魚，但因缺乏數據記錄，其後代或會以為每日捕獲 10 條魚便是豐收。
Pauly 並不接受地中海為貧瘠海域的主張，從羅馬記載得知，海中或曾有大量灰鯨，牠們從更廣闊的大西洋帶來營養，透過其糞便使海洋肥沃，後來或遭羅馬人獵殺而絕跡。Mylona 將繼續為更豐富的地中海遺產進行論證：「近年歐盟愈來愈關注海洋生態，也為我們提供了研究資金…… 現時考古學家面臨的最大挑戰，是築起海洋生物學與海洋保護之間的橋樑，有效運用從考古和歷史學所得的漁業數據。」
