抗生素失效的時代逼近，醫學界或借鑑古法或生物勘探，不斷探尋抗生素以外的出路。近年有「糞便微生物移植」一法冒起，借助健康捐贈者的糞便細菌為病人治病，根治抗藥性強的超級細菌感染。不過此法動輒需要出動直腸鏡或鼻管，叫人望而生畏，有學者更進一步，研發出「糞便藥丸」，轉化糞便成口服藥，臨床實驗亦證明成效可比傳統方法。
糞便微生物移植法的研究應用範圍愈見廣泛，逐漸延伸至對付出現抗藥性的超級細菌如抗萬古黴素腸球菌（Vancomycin-resistant Enterococcus faecium）和克雷伯氏肺炎菌（Klebsiella pneumoniae）。目前此法普遍用於治療艱難梭菌（Clostridium difficile）感染患者。艱難梭菌感染會導致腹瀉和偽膜性結腸炎，嚴重者更可致命，單計 2011 年美國便有 2.9 萬人死於此症，而且因其抗藥性強，病人即使服用抗生素，癒後亦容易復發。不過，若接受糞便微生物移植，消滅抗藥性細菌，平衡腸道微生物，病人復發率則可大大降低。
糞便藥丸
糞便有療效，但現時的移植方式始終不若傳統服藥舒適方便。阿爾伯塔大學最近就嘗試將糞便加工，經過防腐、冷藏等處理，製成藥丸，進行臨床實驗比較口服糞便和傳統移植法的療效差異。
研究共有 116 名受艱難梭菌復發性感染病人參與，研究員隨機將他們分成兩組，其中 57 人口服糞便藥丸 ，其餘 59 人則透過直腸鏡方式接受糞便微生物移植。結果，治療後 12 周 96.2% 病人再無復發感染，證明大便藥丸療效可比傳統移植法。糞便藥丸成本較低，而且口服糞便藥丸比之灌腸怡人得多，大部分服食藥丸的受驗者都表示治療「完全沒有造成不適」。研究論文日前刊登於「美國醫學會雜誌」，研究作者 Dina Kao 對實驗結果感到鼓舞：「真是瘋了，我們從未在其他藥物中見識過這種程度的療效。」
糞便如何治病？
雲德標大學生物學家 Seth Bordenstein 解釋：「糞便可救命這點無庸置疑。它是一種複雜的物質，所含多樣微生物及化學物都有醫療作用。」每克健康人類的糞便，就有 1 億病毒和古菌，千萬結腸上皮細胞，上百萬酵母菌和其他單細胞真菌等等，它們互為作用，形成一個微生物組。將健康糞便移植至病人身上，重建腸道微生物系統平衡，有助抗惡菌，除了艱難梭菌，糞便微生物移植更可治療便秘、腸易激綜合症和柏金遜症。近年糞便的醫療價值逐漸受到重視，今年初香港更成立亞洲首間「糞便銀行」，高價收購糞便以資研究。
糞便治病成效有目共睹，但糞便中具醫療成效的成分仍是一個謎。最近就有一小型研究發現，除菌後的糞便同樣能有效治病，意味具療效的可能只是糞便中的某種非細菌微生物。Kao 也承認尚未摸清其治療機制：「糞便何其複雜，我們還未完全了解它。」
